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制備性色譜和分析性色譜
色譜法的應用可以根據目的分為制備性色譜和分析性色譜兩大類。
制備性色譜：
制備性色譜的目的是分離混合物，獲得一定數量的純凈組分，這包括對有機合成產物的純化、天然產物的分離純化以及去離子水的制備等。相對于色譜法出現之前的純化分離技術如重結晶，色譜法能夠在一步操作之內完成對混合物的分離，但是色譜法分離純化的產量有限，只適合于實驗室應用。
分析性色譜：
分析性色譜的目的是定量或者定性測定混合物中各組分的性質和含量。定性的分析性色譜有薄層色譜、紙色譜等，定量的分析性色譜有氣相色譜、液相色譜等。色譜法應用于分析領域使得分離和測定的過程合二為一，降低了混合物分析的難度縮短了分析的周期，是比較主流的分析方法。在中華人民共和國藥典中，共有超過約600種化學合成藥和超過約400種中藥的質量控制應用了液相色譜的方法。
色譜法是分析化學中應用zui廣泛發展zui迅速的研究領域，新技術新方法層出不窮。
新固定相的研究：
固定相和流動相是色譜法的主角，新固定相的研究不斷擴展著色譜法的應用領域，如手性固定相使色譜法能夠分離和測定手性化合物;反相固定相沒有死吸附，可以簡單地分離和測定血漿等生物藥品。
檢測方法的研究：
檢測方法也是色譜學研究的熱點之一，人們不斷更新檢測器的靈敏度，使色譜分析能夠更靈敏地進行分析。人們還將其他光譜的技術引入色譜，如進行色譜-質譜連用、色譜-紅外光譜連用、色譜-紫外連用等，在分離化合物的同時即行測定化合物的結構。色譜檢測器的發展還伴隨著數據處理技術的發展，檢測獲得的數據隨即進行計算處理，使試驗者獲得更多信息。
專家系統：
專家系統是色譜學與信息技術結合的產物，由于應用色譜法進行分析要根據研究內容選擇不同的流動相、固定相、預處理方法以及其他條件，因此需要大量的實踐經驗，色譜專家系統是模擬色譜專家的思維方式為色譜使用者提供幫助的程序，專家系統的知識庫中存儲了大量色譜專家的實踐經驗，可以為使用者提供關于色譜柱系統選擇、樣品處理方式、色譜分離條件選擇、定性和定量結果解析等幫助。
色譜新方法：
色譜新方法也是色譜研究熱點之一。毛細管電泳法是目前研究zui多的色譜新方法，這種方法沒有流動相和固定相的區分，而是依靠外加電場的驅動令帶電離子在毛細管中沿電場方向移動，由于離子的帶電狀況、質量、形態等的差異使不同離子相互分離。毛細管電泳法沒有HPLC方法中存在的傳質阻抗、渦流擴散等降低柱效的因素，縱向擴散也因為毛細管壁的雙電層的存在而受到抑制，因而能夠達到很高的理論塔板數，有*的分離效果
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